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一株引起嚴重急性呼吸道感染病例的A亞型人呼吸道合胞病毒全基因組基因特征分析

作者:杜佳; 徐瑾; 崔愛利; 許文波; 張燕 國家衛(wèi)生健康委員會醫(yī)學病毒和病毒病重點實驗室(中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所)、世界衛(wèi)生組織西太平洋地區(qū)麻疹/風疹參比實驗室; 北京102206; 河南省疾病預防控制中心; 鄭州450016

摘要:人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是導致兒童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根據(jù)對單克隆抗體的反應,HRSV分為A、B兩個亞型。為探討嚴重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI)病例中HRSV全基因組基因特征,本研究對2017年河南省漯河市住院SARI病例中檢測到的1株HRSV A亞型病毒通過Sanger測序方法對其全基因組序列進行了測定和分析。通過Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05、BioEdit 7.0.5等生物信息學軟件進行序列拼接和比對,進行了基因親緣性關系分析、氨基酸變異和糖基化位點分析?;贖RSV全基因組序列和11個單個蛋白基因序列構建的親緣性關系分析結果提示本研究中檢測到的這株HRSVA病毒(RSVAs/Luohe.Henan/CHN/42.17)屬于ON1基因型,該型是我國近年流行的優(yōu)勢基因型。該病毒全基因組序列與35條全球代表株的核苷酸和氨基酸同源性分別為92.69%~99.82%和93.63%~99.67%;G蛋白編碼區(qū)氨基酸變異最高,而F蛋白相對保守。糖基化位點分析發(fā)現(xiàn),該病毒的F蛋白有6個N-糖基化位點,未發(fā)現(xiàn)O-糖基化位點,此結果與原型株long株相同;G蛋白N-糖基化位點有6個,O-糖基化位點為82個,而原型株long株有11個N-糖基化位點,15個O-糖基化位點。本研究對2017年河南省漯河市SARI病例中一株HRSVA病毒全基因組序列進行了測定,與世界其他地區(qū)報道的HRSVA亞型病毒全基因組序列進行了對比分析,揭示了SARI病例中我國HRSV優(yōu)勢流行ON1基因型病毒全基因組的核苷酸和氨基酸變異特征,以及G蛋白和F蛋白編碼區(qū)糖基化情況,豐富了我國HRSV基因數(shù)據(jù)庫,也為HRSV的核酸檢測方法的建立、疫苗研發(fā)和預防性單克隆抗體的評價提供了核苷酸和氨基酸的基礎數(shù)據(jù)。

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病毒學報雜志, 雙月刊,本刊重視學術導向,堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:病毒研究專題論著、流感病毒研究論著、人類病毒研究論著、動物病毒研究論著、昆蟲病毒研究論著、病毒研究專題綜述、綜述、信息等。于1985年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。

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