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氟苯尼考耐藥基因floR LAMP檢測方法的建立及應(yīng)用

作者:馮世文; 李軍; 潘艷; 彭昊; 賀會利; 鐘舒紅; 胡帥; 曾蕓 廣西獸醫(yī)研究所; 廣西南寧530001; 廣西獸醫(yī)生物技術(shù)重點實驗室; 廣西南寧530001; 廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院; 廣西南寧530004

摘要:為建立快速、靈敏且可定量檢測氟苯尼考耐藥基因floR的環(huán)介導(dǎo)等溫擴增方法(LAMP),根據(jù)GenBank登錄的革蘭陰性菌floR基因保守序列,利用PrimerExploerV4設(shè)計特異性LAMP引物,成功建立了快速檢測氟苯尼考耐藥floR基因的LAMP方法。該LAMP檢測方法反應(yīng)溫度為63℃,反應(yīng)時間為60min,具有可實時監(jiān)測反應(yīng)、定量檢測出floR基因的拷貝數(shù),以及操作簡便的特點,靈敏度高,檢測限為6.24×100拷貝,是普通PCR的100倍。用建立的方法檢測對氟苯尼考不同敏感性的大腸埃希菌floR基因,結(jié)果顯示,對氟苯尼考敏感、中介和耐藥的菌株均檢測到floR基因,其拷貝數(shù)與菌株MIC相關(guān),提示floR基因不僅存在于氟苯尼考耐藥菌中。所建立的floR基因LAMP檢測方法可為floR基因的監(jiān)測,以及氟苯尼考耐藥性產(chǎn)生和傳播機制的研究提供新的技術(shù)手段。

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