紫背天葵及其近緣種白子菜花青素合成相關(guān)基因分析
摘要：【目的】獲取紫背天葵花青素合成代謝核心酶系列信息,為進(jìn)一步從事紫背天葵或其他特色植物中花青素合成代謝相關(guān)基礎(chǔ)研究提供依據(jù)。【方法】以紫背天葵為材料,以其近緣種白子菜為對(duì)照,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。【結(jié)果】在獲取的80798條單基因簇中,通過8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析,共有43369條注釋到相關(guān)信息。這些單基因簇在NR及Swiss-Prot這2個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中注釋到花青素合成代謝相關(guān)系列酶為104個(gè),具體包括10個(gè)查爾酮合成酶、5個(gè)查爾酮異構(gòu)酶、36個(gè)黃烷酮3-羥化酶、19個(gè)二氫黃酮醇4-還原酶、9個(gè)花青素合成酶和25個(gè)類黃酮3-O-糖基轉(zhuǎn)移酶。通過FPKM均值統(tǒng)計(jì)分析可知,這6大家族酶在該兩種野菜中表達(dá)量差異明顯的分別有1、1、3、4、2、4個(gè)。在這15個(gè)差異表達(dá)明顯基因中,上調(diào)基因7個(gè)、下調(diào)基因8個(gè)。【結(jié)論】獲取的紫背天葵及其近緣種白子菜中的104個(gè)相關(guān)酶系列信息中,有15個(gè)與紫背天葵花青素合成代謝密切相關(guān)。
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福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：園藝科學(xué)、動(dòng)物科學(xué)、植物保護(hù)、資源與環(huán)境科學(xué)、食品科學(xué)等。于1986年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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