馬鈴薯MYB轉錄因子基因的序列分析
摘要：MYB基因家族是植物中最大的一類轉錄因子家族,廣泛參與植物的生長發(fā)育和代謝調控過程。本研究通過生物信息學方法對美國國立生物技術信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)中篩選的16條馬鈴薯MYB基因進行分析,預測其分子量和等電點等理化性質、基序、二級結構和三級結構,并用MEGA 5.0與已報道具有明確功能的20個MYB蛋白進行多序列比對分析并構建系統(tǒng)進化樹。結果表明:馬鈴薯中篩選出16個的MYB基因蛋白大小在104~379 aa,分子量和等電點分別介于66 877.11~147 918.09 k D和4.95~5.16之間;基序預測得到3個特征基序,最長的基序含50個氨基酸;α-螺旋和無規(guī)則卷曲是主要的二級結構,三級結構中都含有螺旋-轉角-螺旋結構;進化樹分析中,其中StMYB12與SIMYB12同源性高,StMYBA1、St AN1和StMYB113與矮牽牛AN2同源性高,StMYB21與MdMYB1有同源性,推測馬鈴薯的St MYB12、St MYBA1、StAN2、St AN1、StMYB113和StMYB21可能參與花青素合成代謝調控,這為下一步馬鈴薯花色素苷合成調控相關MYB基因功能研究提供參考依據(jù)。
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分子植物育種雜志
分子植物育種雜志， 半月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內容涉及的欄目：基因組學及功能基因_研究報告、基因組學及功能基因_評述與展望、基因工程育種_研究報告、標記輔助育種_研究報告、現(xiàn)代遺傳育種_研究報告、表型性狀與分子性狀_研究報告種質資源_研究報告、田間試驗與栽培技術_研究報告、田間試驗與栽培技術_評述與展望等。于2003年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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