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山羊CXCR1基因的克隆及組織表達(dá)譜研究

作者:徐濤; 王利; 魏勇 西南民族大學(xué)青藏高原研究院; 成都610041; 西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院; 成都610041; 四川畜牧科學(xué)研究院; 成都610041

摘要:為了探究山羊C-X-C趨化因子受體1(C-X-C motif chemokine receptor 1,CXCR1)基因的特點(diǎn),試驗(yàn)以金堂黑山羊脾臟cDNA為模板克隆了CXCR1基因,借助生物信息學(xué)軟件及在線軟件分析序列,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測CXCR1基因在金堂黑山羊脾臟、肺臟、肌肉、心臟和腸的5個(gè)組織中的相對(duì)表達(dá)量。結(jié)果表明:克隆得到的CXCR1基因序列全長為1 140 bp,完整CDS編碼區(qū)長1 107 bp,共編碼368個(gè)氨基酸;所得氨基酸序列與牛進(jìn)行比對(duì),兩者同源性為96.8%;編碼蛋白為帶正電荷、具有疏水性的穩(wěn)定蛋白;有7個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)和32個(gè)磷酸化位點(diǎn),無信號(hào)肽;二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋比例最高,為54.35%;獲得的三級(jí)結(jié)構(gòu)模型與人的CXCR1蛋白(PDB:2lnl.1.A)同源性最高,為81.49%;氨基酸比對(duì)結(jié)果與系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果相近,金堂黑山羊與牛的親緣關(guān)系最近;CXCR1基因主要表達(dá)于肌肉和心臟。說明CXCR1基因可能在山羊肌肉發(fā)育相關(guān)的信號(hào)通路中發(fā)揮作用。

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