基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)顱內(nèi)動(dòng)脈瘤形成與破裂相關(guān)基因的挖掘與分析
摘要：目的:基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘與顱內(nèi)動(dòng)脈瘤(IA)形成和破裂相關(guān)的潛在基因。方法:從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中收集IA人群研究的mRNA基因芯片共計(jì)133例。在GEO2R平臺(tái)內(nèi)對(duì)各組的數(shù)據(jù)做差異mRNA基因分析,篩選出共同差異基因并完成基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析。將篩選出的差異基因?qū)隨tring在線數(shù)據(jù)庫(kù),獲得差異基因所編碼的蛋白質(zhì)之間的相互作用。結(jié)果:篩選出共同差異基因42個(gè),主要參與的生物學(xué)過(guò)程包括RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子對(duì)氧化應(yīng)激反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控、趨化因子產(chǎn)生的正向調(diào)節(jié)、巨細(xì)胞自噬的陽(yáng)性調(diào)節(jié);主要發(fā)揮的分子功能包括蛋白質(zhì)結(jié)合、RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄輔阻遏活性、轉(zhuǎn)錄激活因子活性和蛋白激酶C結(jié)合;在細(xì)胞組分方面不呈現(xiàn)富集狀態(tài)。主要覆蓋的信號(hào)通路包括缺氧誘導(dǎo)因子-1信號(hào)通路、胰高血糖素信號(hào)通路和代謝途徑信號(hào)通路。結(jié)論:初步篩選出IA的形成與破裂可能與偕胺肟還原組件1、腫瘤壞死因子-α誘導(dǎo)蛋白6、結(jié)合珠蛋白、肥大細(xì)胞膜表達(dá)蛋白1、ZAK、磷脂酶Cβ4以及血液和神經(jīng)系統(tǒng)表達(dá)因子1等蛋白所介導(dǎo)的生物學(xué)功能過(guò)程相關(guān),除了既往已知的IA機(jī)制外,細(xì)胞自噬和HIF-1通路可能也參與了IA的形成。
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