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小麥丙氨酸-乙醛酸轉(zhuǎn)氨酶基因(TaAGT2)的克隆、生物信息學(xué)預(yù)測及表達(dá)分析

作者:吳凡; 徐德芳; 宋少帥; 李超卿; 穆平 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 山東青島266109; 東營市農(nóng)業(yè)科學(xué)院; 山東東營257091

摘要:光呼吸是植物細(xì)胞H2O2的重要來源,也是維持細(xì)胞氧化還原的重要成分,影響植物對生物和非生物逆境的應(yīng)答,因此,挖掘與光呼吸有關(guān)的基因?qū)μ岣咧参锏目鼓嫘跃哂兄匾饬x。本研究以耐旱小麥品種青麥6號轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過RACE技術(shù)克隆得到小麥 AGT2基因的全長cDNA,將其命名為 TaAGT2,并對其進(jìn)行了生物信息學(xué)預(yù)測及表達(dá)模式分析。結(jié)果表明, TaAGT2開放閱讀框長1 434bp,編碼477個(gè)氨基酸。該蛋白屬于親水性穩(wěn)定蛋白,定位于線粒體中,二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋(42.14%)和無規(guī)則卷曲(32.91%)為主。 TaAGT2基因包含AAT-I基因族保守區(qū)域,與二穗短柄草 AGT2的相似性高達(dá)97%。通過qRT-PCR對基因 TaAGT2在不同組織中(根、莖和葉)及4種非生物脅迫(低溫、ABA、干旱、高鹽)下的表達(dá)特性進(jìn)行分析,結(jié)果表明, TaAGT2在根、莖和葉中均有表達(dá),莖中的表達(dá)顯著高于根和葉,在不同脅迫條件下上調(diào)表達(dá),表明該基因可能參與調(diào)控植物的抗逆反應(yīng)。

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麥類作物學(xué)報(bào)

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