摘要：使用分子動(dòng)力學(xué)模擬方法,通過對比產(chǎn)物在不同結(jié)合位置時(shí)的構(gòu)象和對其相互作用的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,研究了Cel48F水解前后及產(chǎn)物排出過程中酶與產(chǎn)物間相互作用的變化,揭示了一些關(guān)鍵殘基及其作用.結(jié)果表明,在底物剛發(fā)生水解后,產(chǎn)物主要在Glu 44和Trp 611輔助下向出口移動(dòng)一個(gè)小的距離,使其遠(yuǎn)離剩余底物和關(guān)鍵催化殘基,防止逆反應(yīng)發(fā)生,在繼續(xù)向出口移動(dòng)過程中,在產(chǎn)物結(jié)合裂縫上方的殘基Trp 411的疏水相互作用下,內(nèi)側(cè)糖單元向上方移動(dòng)并與Trp 411相鄰的Thr 410形成氫鍵,而外側(cè)糖單元在Asp 494作用下移動(dòng)很小,使產(chǎn)物在裂縫中轉(zhuǎn)動(dòng),有利于外界水分子進(jìn)入并包裹產(chǎn)物,最終實(shí)現(xiàn)產(chǎn)物排出.