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珠子參實(shí)時(shí)熒光定量PCR體系的建立與優(yōu)化

作者:張小海; 羅飛; 王廣; 張瑩; 左天; 張紹鵬 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院; 湖北武漢430023

摘要:實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種快速用于鑒定基因表達(dá)量的方法,廣泛用于微生物、植物和動物基因表達(dá)分析中。通過選取合適的內(nèi)參基因β-actin構(gòu)建珠子參實(shí)時(shí)熒光定量PCR體系,為珠子參及其近緣種的基因表達(dá)分析奠定基礎(chǔ)。主要從兩個(gè)最基本的要素進(jìn)行體系優(yōu)化,即引物濃度和模板濃度。優(yōu)化先從模板濃度開始,設(shè)置模板濃度梯度分別為120ng/μL、24ng/μL、4.8ng/μL、0.96ng/μL、0.192ng/μL,基于擴(kuò)增曲線和擴(kuò)增效率的計(jì)算,得出擴(kuò)增效率最高的一組,即為最優(yōu)模板濃度。然后進(jìn)行引物濃度優(yōu)化,在最優(yōu)模板濃度基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)一系列的引物濃度分別為10μmol/L、5μmol/L、2.5μmol/L、1.25μmol/L、0.625μmol/L,基于擴(kuò)增曲線和擴(kuò)增效率,確定最佳的引物濃度。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,當(dāng)模板濃度為120ng/μL,引物濃度為10μmol/L時(shí)PCR的擴(kuò)增效率最高。在珠子參中首次建立和優(yōu)化了以β-actin基因作為內(nèi)參基因的實(shí)時(shí)熒光定量PCR體系。

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武漢輕工大學(xué)學(xué)報(bào)

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