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兩種HLA分型方法對比

作者:原應博; 方銘 黑龍江八一農墾大學; 黑龍江大慶163319; 集美大學; 福建廈門361021

摘要:對比兩種HLA分型方法的準確率,通過使用polysolver方法和研究出的新方法這兩種方法對100個個體的全基因組外顯子測序數據(WES)進行分型,然后將兩種方法的分型結果與這100個個體的sanger一代測序結果進行比較,找到新方法的優(yōu)點和不足,并且為動物MHC基因研究提供算法基礎。經過新方法的開發(fā)以及優(yōu)化,最終與polysolver方法的結果進行比較,得出結論,發(fā)現研究的新方法與polysolver分型方法相比準確率相對較高,且運行時間相對較短。兩種方法均只能對HLA一類分子進行分型,這一點在將來實驗中會進一步改進。

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